[1]苏州大学附属第一医院神经外科,215006
[2]复旦大学遗传工程国家重点开放实验室
目的:运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行研究。方法:抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对6811705克隆子进行Northern blot,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),染色体定位和生物信息学分析。结果:通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northern blot证实6811705基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。PPIL3基因位于染色体2q33区段的STS marker stSG2762和SHGC-3074之间。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为eyelophilin-like gene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。结论:基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。6811705基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。
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